“Que tipos de problemas podem ocorrer com shields e outros circuitos montados em matriz de contatos quando acoplados a microcontroladores comuns, como Arduino?”

Em princípio, quando os circuitos são de baixa frequências ou menos sensíveis aos ruídos nada pode ocorrer de errado com a sua montagem em matrizes de contato. No entanto, existem casos em que o circuito mais sensível pode captar ruídos, por exemplo, no caso do uso de uma entrada sensora analógica em que a alta impedância a torna sensível a ruídos. Isso pode exigir precauções especiais como a redução do comprimento dos fios, o uso de blindagem e até um desacoplamento entre as fontes do circuito externo e do microcontrolador (se forem diferentes) ou uma filtragem melhor estudade.